Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms