Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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