Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cited1P97769 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms