Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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