Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bop1P97452 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bop1P97452 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Bop1P97452 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms