Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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