Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms