Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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