Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Otx2P80206 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Otx2P80206 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Otx2P80206 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms