Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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