Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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TspoP50637 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TspoP50637 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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