Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms