Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VdrP48281 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms