Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd4P46935 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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