Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtbP41155 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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