Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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