Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms