Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PcnaP17918 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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