Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms