Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cnih2O35089 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cnih2O35089 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms