Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms