Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms