Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3tc1G3X9F6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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