Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NpcdF8VQB8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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