Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms