Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd34aB2RW11 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms