Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms