Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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H2-M5A7VMS3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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