Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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