Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms