Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Sfrp4Q9Z1N6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sfrp4Q9Z1N6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sfrp4Q9Z1N6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sfrp4Q9Z1N6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sfrp4Q9Z1N6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms