Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms