Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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