Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrmuQ9DAT5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms