Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms