Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpn3Q9D3W4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms