Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rprd1bQ9CSU0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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