Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms