Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc18Q9CQ07 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms