Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cep41Q99NF3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cep41Q99NF3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms