Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms