Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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