Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms