Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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