Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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