Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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