Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms