Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bcas3Q8CCN5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms