Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms