Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Htatsf1Q8BGC0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htatsf1Q8BGC0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms